قدمت المؤسسة خلال العام مساعدات متعددة لليمن لاجتياز الظروف التي يمر بها هذا البلد الشقيق .. وقد اقامت المؤسسة خلال العام جسرا جويا ضم 12 طائرة شحن حملت 400 طن من المواد الغذائية والإغاثية الرمضانية إلى سكان جزيرة سقطرى اليمنية. واستفاد من حمولة هذه الطائرات الاف اليمنيين الذين تلقوا مساعدات من المواد الغذائية ومستلزمات منزلية .وثمنت الأسر المستفيدة المكرمة الإماراتية التي جاءت في وقتها حيث يعاني السكان شظف العيش من قلة الموارد وضيق الحال .. وقالوا إن مساعدات الامارات ليست الأولى فقد تعود السكان على تلقي المساعدات من المؤسسة التي لها بصمات إنسانية مهمة في الجزيرة اذ قامت ببناء مستشفى الشيخ خليفة في الجزيرة الذي يستقبل المرضى ويقدم لهم العلاج المجاني.وفي شهر نوفمبر من العام 2016 سلمت مؤسسة خليفة الإنسانية الدفعة الأولى من سيارات ذات دفع رباعي الى شرطة محافظة ارخبيل سقطرى وذلك لدعم جهاز الشرطة وذلك في إطار الدعم المتواصل لتعزيز الأمن في جزيرة سقطرى. وتأتي هذه المساعدات إلتزاما من مؤسسة خليفة الإنسانية بتنفيذ توجيهات القيادة الرشيدة لإغاثة الشعب اليمني الشقيق انطلاقا من مشاعر الأخوة تجاهه وحرص القيادة على تخفيف معاناته في الظروف الصعبة التي يمر بها حاليا ..